Le CPSU est la division du SCFP-Québec qui représente les travailleurs (personnel de soutien, chargés de cours et chargés d'encadrement) du secteur universitaire. Le SCFP-Québec qui représente environ 110 000 travailleurs à travers la province est une division du SCFP qui représente plus de 500 000 travailleurs à travers la Canada. Sur une base volontaire, les syndicats faisant partie du SCFP-Québec peuvent s'affilier à la FTQ et à leurs Conseils régionaux. Tous les syndicats du SCFP peuvent s'affilier au Congrès du travail du Canada.
Le Congrès qui se tient tous les 2 ans est l'instance suprême du CPSU. Ce sont les personnes déléguées au congrès qui déterminent la ligne à suivre jusqu'au prochain congrès.
Entre les congrès, c'est le Comité de liaison, composé des membres du bureau et d'un ou deux représentants de chacune des sections locales qui prend les décisions. Le Comité de liaison est le moment idéal pour permettre aux personnes déléguées de discuter de leur réalité et de participer à des thématiques.
Le Bureau du CPSU gère quotidiennement les affaires courantes (organisation des comités de liaison, des activités demandées par les sections locales, etc.)
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